Ні, не може.

Роботодавець не має права проігнорувати електронний листок непрацездатності працівника, що відображається в електронному кабінеті страхувальника на порталі електронних послуг ПФУ. Прохання працівника «не враховувати наявність лікарняного» немає значення – Ви не можете за його проханням порушувати законодавство.

За Ваших обставин потрібно видати наказ про перенесення відпустки – адже відповідно ж до п. 1 ч. 2 ст. 11 Закону «Про відпустки» (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/504/96-%D0%B2%D1%80/conv#n131) щорічна відпустка повинна бути перенесена на інший період або продовжена у разі тимчасової непрацездатності працівника, засвідченої у встановленому порядку. Оскільки продовжити відпустку Ви не можете, бо вона до відкриття лікарняного ще не почалася, то її потрібно перенести, одночасно скасувавши наказ про надання відпустки. Зразок такого наказу є у нашому розділі «Документи» за посиланням: https://api.kadroland.com/documents/download/6893.

Раді допомогти, звертайтесь ще!