Так, повідомлення має підписати в.о. начальника підприємства.

Оскільки під час перебування Вашого начальника підприємства на лікарняному його обов'язки виконує головний інженер, то і усі кадрові документи, у т. ч. й повідомлення про зміну істотних умов праці, має підписувати саме він (також і повідомлення начальнику підприємства, і «самому собі»).

Лише зверніть увагу, що усі повідомлення головний інженер має підписувати, вказуючи своє ім'я та прізвище, але як «в.о. начальника підприємства», а не «головний інженер». У повідомленні ж «самому собі» як адресат має бути вказано посаду головного інженера, а як підпис – в.о. начальника підприємства (незважаючи на те, що це одна і та ж людина, він повідомляє себе про зміну істотних умов праці як головного інженера, а надає таке повідомлення від імені в.о. начальника підприємства).

Повідомити про зміну істотних умов праці начальника підприємства, який перебуває на лікарняному (як і будь-якого працівника), Ви можете будь-яким способом – можна і через месенджери, оскільки відповідно до ч. 2 ст. 7 Закону «Про організацію трудових відносин в умовах воєнного стану» (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2136-20/conv#n27) під час дії воєнного стану обмін документами роботодавець та працівник можуть здійснювати в електронному вигляді. Проте допоки начальник підприємства не надасть свою згоду або відмову від продовження роботи у змінених умовах праці, Ви не зможете ні змінити йому умови праці, ні звільнити – під час лікарняного працівник не зобов'язаний отримувати та підписувати будь-які повідомлення, тож якщо начальник підприємства не надасть згоду чи не відмовиться від роботи у змінених умовах праці під час лікарняного (він також може надіслати її в електронному вигляді), то поки лікарняний не буде закрито, змінювати його істотні умови праці не можна.

Раді допомогти, звертайтесь ще!