У вас невірно оформлена така особа за ТД. ФОП може працювати у іншого роботодавця за трудовим договором. Підприємницька діяльність не є трудовою діяльністю. Але така фізособа може працювати в іншого роботодавця за трудовим догоровом. Якщо це єдине місце роботи, то таку фізособу приймають на основне місце роботи. Статтею 21 КЗпП https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08#Text визначено, що працівник має право реалізувати свої здібності до продуктивної і творчої праці шляхом укладення трудового договору на одному або одночасно на декількох підприємствах, в установах, організаціях, якщо інше не передбачено законодавством, колективним договором або угодою сторін. Отже, якщо така особа має основне місце роботи, то її можна прийняти за іншим трудовим договором на умовах сумісництва. Якщо іншого місяця роботи немає, то приймайте на основне місце роботи. При цьому законодавство обмежень щодо тривалості робочого часу для особи яка є ФОПом не містить. Тобто ви такого ФОПа як звичану фізичну особу мали прийняти на роботу за основним місцем роботи, а не за сумісництвом. Тому вам потрібно виправити кадрові документи. Тоді ЛН буде повністю оплачений за основним місцем роботи (як перші 5 днів за рахунок роботодавця, так і допомога від ПФУ). Якщо ви не виправите документи, то оплатити ЛН не буде можливим. Адже для оплати за сумісництвом, має бути довідка з основного місця роботи про середню ЗП, а у вас працівник такої довідки надати не може, оскільки підприємницька діяльність - це не основне місце роботи.

Раді допомогти, звертайтесь ще!