Ні, це буде неправильним.

Ви оформили директору суміщення – тобто він виконує обов'язки за іншою посадою, а тому підписів має бути два, і як директора, і як бухгалтера (хоч це підпис і однієї й тієї ж фізичної особи, проте від різних посадових осіб). Тож директору слід оформити другий ЕЦП з типом підпису «бухгалтер» і надалі підписувати звітність і як директор, і як бухгалтер.

Якщо ж Ви маєте бажання, аби директор все робив лише за своїм одним підписом, то Вам слід змінити його посадову інструкцію, внести відповідні зміни до його строкового трудового договору (контракту), скасувати суміщення та вивести зі штатного розпису посаду бухгалтера.

Раді допомогти, звертайтесь ще!