Так, можете.

Відповідно до ч. 3 ст. 119 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08/conv#n709) за працівниками, призваними на військову службу, у т. ч. і за мобілізацією, на особливий період, на строк до його закінчення або до дня фактичного звільнення зі служби зберігаються місце роботи і посада на підприємстві, на якому вони працювали на час призову. Але наведена норма є гарантією збереження робочого місця за окремими категоріями працівників на певний період, а не їх обов'язку повернутися на це місце роботи – тому якщо Ваш працівник має бажання звільнитися, то Ви можете провести це звільнення і у період його перебування на військовій службі за ст. 38 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08/conv#n218) (за власним бажанням).

Неявка працівника на роботу з нез'ясованих причин протягом певного періоду також не є перепоною для звільнення за власним бажанням (у такому разі пояснення від працівника Ви можете не вимагати, оскільки він і так звільняється).

Тож незалежно від того, мобілізовано працівника чи ні, за власним бажанням його можна звільнити (наказ про звільнення буде стандартним, для його видання потрібна лише заява працівника).

Раді допомогти, звертайтесь ще!