Так, зараховується.

Час проходження військової служби в Україні, зокрема в особливий період, зараховується до страхового стажу, стажу роботи, вислуги років, а також стажу державної служби. Однак порядок зарахування залежить від дати проходження служби та наявності підтвердних документів або записів у Реєстрі застрахованих осіб.

Стаж зараховується:

до 1 січня 2004 року – на підставі військових квитків, довідок, виданих територіальними центрами комплектування та соціальної підтримки, військовими частинами, установами Міноборони, архівними або військово-лікувальними установами;
з 01.01.2016 до страхового стажу зараховуються, зокрема, період сплати ЄСВ із грошового забезпечення за осіб, які проходять військову службу та службу в органах МВС.
Умови, для визначення страхового стажу для оплати лікарняних, визначає стаття 14 Закону України «Про загальнообов’язкове державне соціальне страхування» від 23.09.1999 № 1105.https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/1105-14#n1298

Раді допомогти, звертайтесь ще!