Необхідність проходження ВЛК для військового обліку працівника

Ні, не потрібно.
Відповідно до п. 63 Порядку 560 https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/560-2024-%D0%BF#Text, військовозобов’язані, у яких строк дії відстрочки від призову на військову службу під час мобілізації, на особливий період не завершився, на медичний огляд не направляються, крім випадків, коли військовозобов’язані приймаються на військову службу за контрактом, або були визнані обмежено придатними та не проходили повторний медичний огляд з метою визначення їх придатності до військової служби (за винятком тих, які визнані в установленому порядку особами з інвалідністю), або самостійно виявили бажання пройти медичний огляд.
Отже, військовозобов'язаному з відстрочкою проходити ВЛК не потрібно, відповідно на звірння не впливає.

Також роботодавець не має повноважень направляти на проходження ВЛК.

Адже, відповідно до пункту 3 є Розділу ІІ Положення про військово-лікарську експертизу в Збройних Силах України, затвердженого наказом Міністра оборони України 14.08.2008 № 402, (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/z1109-08/stru#Stru) медичний огляд військовозобов’язаних проводиться за рішенням керівників ТЦК та СП ВЛК ТЦК та СП на збірних пунктах районних (міських) ТЦК та СП або за місцем провадження медичної практики у закладах охорони здоров’я комунальної або державної форми власності лікарями, які включаються до складу ВЛК ТЦК та СП.

Раді допомогти, звертайтесь ще!