Так, може (якщо тільки спеціальне обмеження не міститься у Вашому колективному договорі).

Суміщення – це виконання працівником на тому самому підприємстві водночас зі своєю основною роботою, обумовленою трудовим договором, додаткових функцій за іншою професією (посадою) без звільнення від своєї основної роботи в робочий час без зміни його тривалості. За суміщення професій (посад) обов'язково провадиться доплата (ст. 105 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08#Text)). Суміщення професій (посад) ґрунтується на тому, що суміщувана посада є в штатному розписі підприємства, але залишається вакантною, отже за посадою утворюється економія фонду заробітної плати, за рахунок якої і встановлюють доплату. Оскільки у Вас відповідна посада є вакантною, то начальник відділу може працювати на ній за суміщенням, і, відповідно, отримувати доплату за суміщення. Раніше норми ще радянських актів містили застереження щодо неможливості отримання керівними працівниками державних установ отримання доплати за суміщення, проте наразі вони не застосовуються і таке обмеження може передбачатися лише у колективному договорі чи трудовому договорі (контракті) з конкретним працівником.

Раді допомогти, звертайтесь ще!