Оскільки лікарняний відкритий, як суміснику, а працівник є основним працівником відсутні підстави оплачувати такий лікарняний. До того ж, працівник втратив статус застрахованої особи.

Окрім того, право на страхові виплати за страхуванням у зв’язку з тимчасовою втратою працездатності мають застраховані особи… (ч. 1 ст. 12 ЗУ «Про загальнообов’язкове державне соціальне страхування» https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/1105-14/ed20240101#n1285 ).

Застрахована особа — фізична особа, яка відповідно до законодавства підлягає загальнообов'язковому державному соціальному страхуванню і сплачує (сплачувала) та/або за яку сплачується чи сплачувався у встановленому законом порядку єдиний внесок (ст. 1 ЗУ «Про збір та облік єдиного внеску на загальнообов'язкове державне соціальне страхування» https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2464-17#Text ).

Оскільки працівник тривалий час відсутній на роботі, роботодавець не виплачує йому зарплату і відповідно не платить за нього ЄСВ, він втратив статус застрахованої особи щодо Вашого підприємства. Тож розгляньте лікарняний та відмовте в його оплаті. Підстава в протоколі — ч. 1 ст. 12 Закону.