Ні, не нараховуються, але у другому варіанті наявне значне порушення.

Виконувати будь-які трудові функції без оплати не можна – відповідно до ч. 1 ст. 21 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08/conv#n123) трудовим договором є угода між працівником і роботодавцем, за якою працівник зобов'язується виконувати роботу, визначену цією угодою, а роботодавець зобов'язується виплачувати працівникові заробітну плату (це правило має бути дотримано і у разі, якщо засновник та директор є однією й тією ж особою – при оформленні трудових відносин засновник мав нараховувати собі зарплату як директору). Тож Ваш засновник управляв підприємством як його власник, а не виконував обов'язки директора як найманий працівник, тому і щорічна відпустка йому не нараховується, оскільки трудових відносин не було.

У разі ж, коли не виплачувалася заробітна плата найманому працівнику, який не є засновником підприємства, наявне значне порушення законодавства – робота на умовах трудового договору без оплати праці, у т. ч. і директора, є порушенням законодавства про працю (те, що працівник згоден на безоплатну роботу, на це не впливає), що матиме наслідком фінансову відповідальність у вигляді штрафу у двократному розмірі мінімальної заробітної плати (наразі це 16 000 грн) відповідно до абз. 5 ч. 2 ст. 265 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08/conv#n1422). У разі ж, якщо Ви прийняли на роботу директора за трудовим договором без заробітної плати, Вам потрібно негайно виправити ситуацію – переробити рішення засновника та наказ про прийняття на роботу, встановивши у ньому відповідний оклад, а директор має з дня прийняття на роботу оформити відпустку без збереження заробітної плати до дня, коли Ви почали йому нараховувати зарплату (оскільки Вам потрібна підстава для невиплати зарплати за попередній період). Дні щорічної відпустки за таких обставин з дня прийняття на роботу до закінчення відпустки без збереження зарплати не нараховуються, оскільки згідно з ч. 3 ст. 26 Закону «Про відпустки» (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/504/96-%D0%B2%D1%80/conv#n298) цей період не входить до стажу для надання щорічної відпустки.

Раді допомогти, звертайтесь ще!