Можете підписувати «комбінуючи» способи.

Відповідно до ч. 2 ст. 7 Закону «Про організацію трудових відносин в умовах воєнного стану» (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/2136-20/conv#n27) у період дії воєнного стану сторони трудового договору можуть домовитися про альтернативні способи створення, пересилання і зберігання наказів (розпоряджень) роботодавця, повідомлень та інших документів з питань трудових відносин та про будь-який інший доступний спосіб електронної комунікації, який обрано за згодою між роботодавцем та працівником.

Тобто у період дії воєнного стану обмінятися документами, за взаємною згодою, можна у будь-який спосіб й не обов'язково, аби і працівник, і роботодавець зробили це в один і той же спосіб – чинне законодавство цього не вимагає. Є лише дві умови: це обов'язково повинно бути за взаємною згодою працівника і роботодавця, а також «комбінований» спосіб не має суперечити Вашому внутрішньому Положенню про електронний документообіг (тобто у ньому не повинно бути зазначено, що роботодавець надсилає працівнику підписаний наказ у певний узгоджений спосіб, а працівник підтверджує своє ознайомлення з ним у такий же самий спосіб). Ще краще – зазначити, що припустимо підтверджувати свої підписи у різні узгоджені між собою способи. Жодних штрафів за це не загрожує.

Раді допомогти, звертайтесь ще!