Обидва варіанти допустимі
Можна залишити варіант оформлення в одному наказі, а можна оформляти наказ про тимчасове виконання обовязків відповідалного за ведення військового обліку окремо за потреби.

Повідомляти в ТЦК про тимчасове виконання обовязків відповідального не потрібно.
Не має підвищувати кваліфікацію тимчасово призначеного відповідального. Адже в різний час це можуть бути різні працівники, а функція із ведення військового обліку для них тимчасова і нетривала.

Якщо ж відповідальний буде відсутній тривалий час тоді доречно увільнити відповідального від виконання обов’язків із ведення військового обліку і призначити іншого працівника.
Як правило йдеться про випадки:

відпустки у зв’язку з вагітністю та пологами, за якою зазвичай слідує відпустка для догляду за дитиною;
відпустки без збереження зарплати, яку оформили на весь час воєнного стану;
тривалої тимчасової непрацездатності тощо.
В цьому випадку потрібно подати повідомлення за додатком 1 про увільнення попереднього відповідального від виконання обов’язків; призначення іншого, а також запланувати підвищення кваліфікації працівника, який вестиме військовий облік

Раді допомогти, звертайтесь ще!