В цій ситуації роботодавець не може оплатити лікарняний.

Підставою для призначення допомоги по тимчасовій непрацездатності, по вагітності та пологах є сформований на основі медичного висновку про тимчасову непрацездатність або документа, що засвідчує факт усиновлення дитини, встановлення опіки над дитиною, листок непрацездатності. У разі роботи за сумісництвом, за трудовим договором (контрактом) одночасно із здійсненням підприємницької чи іншої діяльності підставою для призначення допомоги є копія листка непрацездатності, засвідчена підписом керівника і печаткою (за наявності) за основним місцем роботи ( ч. 1 ст. 23 ЗУ «Про загальнообов’язкове державне соціальне страхування» https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/1105-14/ed20250508#n1383 ).

У Вас працівник працевлаштований за основним місцем роботи. Тож підставою призначити допомогу по ТН є оригінал е-лікарняного, а не його копія. В протоколі підставою не оплачувати лікарняний зазначте ч. 1 ст. 23 Закону.

Раді допомогти, звертайтесь ще!