Оскільки це не лічильна помилка, то повернути кошти, виплачені за «подвійну» відпустку, Ви можете лише у разі подання працівником відповідної заяви.

Згідно з п. 1 ч. 1 ст. 1215 Цивільного кодексу України (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/435-15/conv#n5683) не підлягає поверненню безпідставно набута зарплата (а відпускні входять до складу зарплати), якщо роботодавець виплатив її добровільно, за відсутності рахункової помилки та недобросовісності з боку набувача. Оскільки ж у Вашому випадку подвійне надання щорічної відпустки за один і той же робочий рік не є лічильною помилкою і вчинене не внаслідок недобросовісності з боку працівника, то добровільне повернення працівником суми відпускних, виплачених за надану вдруге відпустку, є єдиним варіантом отримати назад зайво виплачену йому суму.

Якщо працівник на це погодиться, він може подати заяву з проханням утримати з його зарплати «зайво» виплачену суму за «другу» відпустку. На підставі такої заяви Ви зможете видати наказ, наприклад, такого змісту: «НАКАЗУЮ: Бухгалтеру такому-то відрахувати із заробітної плати працівника такого-то таку-то суму, сплачену за надлишково надані 24 календарні дні щорічної основної відпустки за 2018–2019 робочий рік. Підстава: заява працівника такого-то».

У разі ж, якщо працівник не погодиться на такий варіант (примушувати його не можна), то Вам доведеться просто «подарувати» працівнику зайво надану вдруге відпустку.

Раді допомогти, звертайтесь ще!