За таких обставин лікарняний оплачувати не потрібно.

Якщо працівник, у т. ч. і директор, під час лікарняного виконував роботу, у табелі за цей період мають бути проставлені не дні тимчасової непрацездатності, а робочі дні, за які повинна бути нарахована зарплата. У такому разі уповноважений із соціального страхування має відмовити в оплаті лікарняного на підставі ч. 1 ст. 15 Закону «Про загальнообов'язкове державне соціальне страхування» (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/1105-14/conv#n1309), згідно з якою допомога по тимчасовій непрацездатності надається застрахованій особі у формі страхових виплат, які повністю або частково компенсують втрату заробітної плати (а якщо директор працюватиме і, відповідно, отримуватиме зарплату, то її втрати немає, тож і підстави для компенсації також).

Раді допомогти, звертайтесь ще!