Так, лікарняні потрібно враховувати.

Розрахунок компенсації за невикористану відпустку регулюється Порядком обчислення середньої заробітної плати, затвердженим постановою Кабінету Міністрів України від 08.02.1995 № 100 (далі - Порядок № 100) https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/100-95-%D0%BF#Text

Відповідно до Порядку 100 обчислення середньої заробітної плати для виплати компенсації за невикористані відпустки проводиться виходячи з виплат за останні 12 календарних місяців роботи, що передують місяцю надання відпустки чи виплати компенсації. При обчисленні середньої заробітної плати враховуються всі суми нарахованої заробітної плати згідно із законодавством та умовами трудового договору, крім визначених у пункті 4 цього Порядку. Тимчасові листи непрацездатності цим пунктом не передбачені.

Отже, якщо у розрахунковому періоді (наприклад, 12 місяців перед відпусткою) працівник перебував на лікарняному, суми, які йому були нараховані за цей період, включаються до загального доходу для обчислення середньої зарплати. У вашому випадку працівник звільняється у листопаді 2025 року, то розрахунковий період — листопад 2024 року – жовтень 2025 року.

Висновок:

усі виплати за листком непрацездатності (від ПФУ і роботодавця) додаються до зарплати за відповідні місяці;
дні непрацездатності не виключаються з кількості календарних днів розрахункового періоду і виплати за них враховуються у дохід.

Раді допомогти, звертайтесь ще!