За власним бажанням чи угодою сторін.

Відповідно до ч. 3 ст. 40 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08/conv#n231) під час будь-якої відпустки, у т. ч. і без збереження зарплати, не допускається звільнення працівника лише з ініціативи роботодавця (приміром, за скороченням), а звільнення за будь-якими іншими підставами, у т. ч. і за власним бажанням за ст. 38 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08/conv#n218) чи за угодою сторін за п. 1 ст. 36 КЗпП (https://zakon.rada.gov.ua/laws/show/322-08/conv#n204), є цілком припустимим.

Тож Ваш директор має подати заяву про звільнення за власним бажанням чи за угодою сторін засновнику підприємства, на підставі якої він прийме рішення про звільнення.

До установчих документів зміни вносити потрібно лише у разі, якщо в них немає положень про можливість управління підприємством безпосередньо його засновником (без укладення трудового договору) – якщо ж така можливість передбачена (як правило, вона відразу вказується у Статуті), то вносити зміни не потрібно.

Раді допомогти, звертайтесь ще!